Sara, te cuento el numero de folio es un numerador interno que maneja SAP que esta amarrado a cada serie de numeración de documentos SAP, cuando sale la ventana para ingresar el numero de folio al momento de imprimir dale click en cancelar o cierra la venta , te va a salir un mensaje que dice "No se ha asignado folio al documento" u algo similar, has esto durante las primeras impresiones y el numero de folio se va a desactivara de manera automática, seguramente como son los primeros comprobantes que estas imprimiendo te aparece el mensaje.
Espero te sirva de ayuda.